Система EES не застосовується до:
громадян країн ЄС;
громадян Ісландії, Ліхтенштейну, Норвегії та Швейцарії;
власників посвідок на проживання або довгострокових віз у країнах Шенгенської зони.
Крім того, Ірландія та Кіпр не беруть участі в системі EES.