Oro uostuose, kuriuose taikoma EES:
asmenys turintys biometrinį pasą gali pasinaudoti savitarnos stotelėmis, kad nuskaitytų pasą ir pateiktų biometrinius duomenis.
Duomenis tikrina pasienio kontrolės pareigūnai.
Gavus patvirtinimą EES skaitmeniniu būdu užfiksuoja asmens atvykimą ar išvykimą iš šalies.
Asmenys neturintys biometrinio paso patikrą turi praeiti pasienio kontrolės poste.