Il sistema EES non viene applicato a:
cittadini dei Paesi UE,
cittadini di Islanda, Liechtenstein, Norvegia e Svizzera,
titolari di permessi di soggiorno o visti per soggiorni di lunga durata nei Paesi Schengen.
Inoltre, Irlanda e Cipro non partecipano al sistema EES.